Зоною діяльності Житомирської митниці визначено: Андрушівський, , Бердичівський, Баранівський, Брусиловський , Володарсько-Волинський, Дзержинський, Ємільчинський, м. Житомир, Житомирський, Коростенський, Коростишівський, Лугинський, Любарський, Малинський, Народницький, Новоград-Волинський, Овруцький, Олевський, Попільнянський, Радомишльський, Ружинський, Червоноармійський, Черняхівський, Чуднівський райони Житомирської області та с.м.т.Вільча Київської області.

Загальна довжина державного кордону з Білоруссю становить 274 км.

До складу митниці входять:

• 5 митних постів
• 5секторів митного оформлення
• 16 самостійних відділів
• 2 служби

У місті Житомир знаходиться 2 відділи митного оформлення. Сектори митного оформлення знаходяться в містах Малин, Новоград-Волинський, Коростишів, Радомишль, Баранівка. Митні пости знаходяться в містах Олевськ, Овруч, Коростень, Бердичів, Новоград-Волинський.